中医认为，人体是一个相互联系的整体，身体的各个部分和器官也不是孤立的，是相互联系在一起的，所以在治疗疾病方面也要有整体观念，不能只见局部，不见整体；也不能只见整体，不见局部。中医治疗疾病的整体观念原则，具体应用时主要体现在诊断、药方和剂量三个方面，它要求这三个方面都要坚持整体观念，具体来说：
(1)诊断上的整体观念。中医认为人体是一个完整的、相互联系的整体。身体的某处发生病痛，不能简单地就事论事，只检查疼痛的部位。对身体的其他部位也要做详细的检查，此处的病痛可能是别的部位的病变所致。比如各种体表的组织器官的病变可能是体内脏腑发生病变导致的。另外，也不能只对全身进行检查，而不检查发生病变的部位，这样做也是十分不科学的。总之，中医对疾病的诊断是既关注整体也兼顾局部。
(2)药方上的整体观念。中医的整体观念对开出的药方具有指导意义，中医的药方特别重视主药和辅药的组合。中医在开药方时，既对主要病症开出药方，还兼顾到了次要疾病，并针对它开出药方；另外，还注意到每种药物的毒性和副作用，一般采用相制性配伍方法。
